Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms