Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms