Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap2lQ7TS74 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ckap2lQ7TS74 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms