Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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