Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2Q3V1H1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms