Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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