Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms