Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms