Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfixP70257 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfixP70257 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms