Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn18P56857 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn18P56857 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn18P56857 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn18P56857 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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