Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms