Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNMO15061 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNMO15061 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms