Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms