Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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