Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms