Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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