Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Krtap1-4Q3V2D6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms