Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms