Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms