Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx2P81066 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms