Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms