Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FxnO35943 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FxnO35943 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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