Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms