Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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