Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms