Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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