Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b3Q921M3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sf3b3Q921M3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms