Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms