Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trim58Q5NCC9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Trim58Q5NCC9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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