Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms