Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RykQ01887 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RykQ01887 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms