Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoa1Q00623 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms