Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3bp1P55194 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3bp1P55194 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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