Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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