Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfraP26618 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfraP26618 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfraP26618 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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