Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxa5P09021 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms