Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f3O35261 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2f3O35261 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms