Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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