Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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