Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms