Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms