Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms