Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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