Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms