Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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