Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms