Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms