Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casp2P29594 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casp2P29594 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms