Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra2P26048 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms