Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms